2016年1月21日，臺灣地區“衛生福利部”發布部授食字第1041304070號令，修正“健康食品申請許可辦法”部分條文。

    “健康食品申請許可辦法”（以下簡稱本辦法）系依據健康食品管理法第七條第五項規定授權，于1999年5月21日訂定公告，續經2006年10月30日、2012年8月29日、2014年1月28日修正。本次修正主要為配合“健康食品查驗登記審查費收費標準”調整為初審審查費、復審審查費二階段收費，故于本條文中敘明分階段繳交規費及文件資料；并敘明初審、復審補件規定；又因應食品安全衛生管理法修正，其對于各食品相關咨議會的名稱系以法律定之，為與該等法定名稱適當區分，故將“健康食品咨議會”名稱修正為“健康食品審議小組”；另考慮法條文字一致性，并使應檢附文件更加明確，酌作文字修正。綜上，故修正“健康食品申請許可辦法”部分條文，其修正要點如下︰

    一、 配合“健康食品查驗登記審查費收費標準”調整為初審審查費、復審審查費分開收費，敘明申請健康食品查驗登記分階段繳交規費及文件數據。（修正條文第二條、第二條之一、第三條、第八條）

    二、 敘明健康食品查驗登記初審、復審補件的期限規定。（修正條文第三條、第六條）

    三、 修正“健康食品咨議會”名稱為“健康食品審議小組”。（修正條文第四條、第八條）

    修正條文對照表詳見：http://www.xmtbt-sps.gov.cn/download.asp?id=8224